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La parte pratica dell'esame si svolge con le stesse modalità di quella del corso di Progettazione e Analisi di Algoritmi (vedere sulla pagina relativa).
Ho messo in rete una versione abbastanza assestata della dispensa sugli algoritmi iterativi (file PDF da 521KB). Potrebbe contenere errori e oscurità: segnalatemi gli uni e le altre.
Ho finalmente pubblicato la descrizione della fase finale del progetto e i risultati parziali fornitimi da alcuni di voi. Li trovate qui, ovvero in fondo alla pagina dedicata al progetto. Ho aggiunto un file Excel con gli ultimi risultati aggiornati: non ho ancora corretto quelli nel file PDF, per cui fate riferimento a questi.
Ho anche aggiunto nuovi dati per testare i vostri eseguibili e confrontarne i risultati. Li trovate in fondo alla pagina dedicata al progetto.
Vi invito a inviarmi ancora i risultati, per completare le tabelle (in particolare, indicandomi se qualcuno dei risultati ancora non
convergenti finalmente converge) e i file con le liste dei legami nel formato definito in laboratorio:
(id (xd yd zd) ih (xh yh zh) ia (xa ya za)
dove
i[d,h,a] sta per l'indice di ciascun atomo (donore, idrogeno, accettore) che forma il legame
x[d,h,a], y[d,h,a] e z[d,h,a] indicano per ciascun atomo (donore, idrogeno, accettore) che forma il legame se esso è
un atomo originale (0) o una copia traslata all'indietro (-1) o una copia traslata in avanti (1).
In laboratorio hanno installato il compilatore Dev C++, che è un ambiente di sviluppo integrato piuttosto semplice, ma completo (si può scaricare dal sito della Bloodshed Software). È una versione beta con qualche problema, ma semplice da usare. In alternativa, per chi ci si orientasse bene, è disponibile il Visual.Net
Altri buoni compilatori C gratuiti per ambiente Windows (in Unix e Linux, ovviamente, c'è il gcc) sono (elenco tutt'altro che esaustivo)