Laboratorio: Clustering di pazienti ALL sulla base del profilo di espressione. Utilizzando i 15 campioni ALL selezionati nella precedente esercitazione (v. AnalisiEsprDiffALL.txt), eseguire i seguenti punti: 1. Clustering dei 15 campioni ALL con i geni selezionati dal t-test, utilizzando: 1.1 Clustering gerarchico con metodi "complete", "single", "average" (v. metodo hclust package stats). Visualizzare i cluster ottenuti tramite dendrogrammi. 1.2 K-means clustering (v. metodo kmeans package stats). Analizzare i cluster ottenuti per diversi valori di k. 1.3 Comparare i cluster ottenuti con i due metodi 1.4 Effettuare clustering gerarchico simultaneo su geni e pazienti e visualizzare i risultati tramite heatmap (heatmap di stats). 2. Clustering dei 15 campioni ALL con i geni selezionati tramite wilcoxon test, utilizzando: 2.1 Clustering gerarchico con metodi "complete", "single", "average" (v. metodo hclust package stats) 2.2 K-means clustering (v. metodo kmeans package stats) 2.3 Comparare i clustering con quelli ottenuti al punto 1. 3. Preparare un report sintetico dei risultati ottenuti.