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Tredicesima lezione (19 novembre 2004)

Comincia qui il progetto finale. Penso di tenere una pagina sola per tutti i materiali e lo sviluppo, aggiornandola via via. Per il momento, ci sono:

• una descrizione del problema (file PDF da 18KB)
• una rapporto interno dei vostri colleghi dello scorso anno (file PDF da 619KB)
• RasMol è un programma di visualizzazione (177 KB)
• Homepage di RasMol: qui dovrebbe esserci l'ultima versione (non provata da noi) e parecchia documentazione
• una sequenza di file relativi a una soluzione acquosa di urea:
  1. frame 1
  2. frame 2
  3. frame 3
  4. frame 4
  5. frame 5
  6. frame 6
  7. frame 7
  8. frame 8
  9. frame 9
  10. frame 10
• una sequenza ravvicinata (cadenza 0.1 ps) di file relativi a una soluzione acquosa di urea (20 file PDB zippati in uno solo per complessivi 451KB)
• una sequenza ravvicinata (cadenza 0.1 ps) di file relativi a una soluzione acquosa di TMAO (20 file PDB zippati in uno solo per complessivi 474KB)
• PDB-Analyzer è il software derivato dal lavoro degli studenti dello scorso anno, da estendere quest'anno
• Documentazione su PDB-Analyzer generata automaticamente da Doxygen (si parte dal file index.html) (file ZIP da 183KB)
• sequenza di file RST: 4 molecole di urea e 500 di acqua (5 snapshot) (file ZIP da 240KB)
• Liste complete dei legami per i file precedenti: modello toroidale (file XLS da 210KB) e modello a guscio (file XLS da 481KB)
• varie sequenza di file RST: diverse molecole di urea (16, 27, 64, 125) e 500 di acqua (5 snapshot per una) (file ZIP da 661KB)

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